Potenciální cíl pro nové antibiotika

Výzkumníci identifikovali v bakteriích unikátní mechanismus, který by podle nové studie mohl pomoci pri vývoji nových antibiotik pro choroby, jako je AIDS a infekce mekkých tkání.
Studie, kterou provedli vedci z College of Medicine v Florida Atlantic University, je publikována online v Journal of Biological Chemistry.
Podle Ravi K. Alluriho, preddoktorského studenta na katedre biomedicínského inzenýrství a doktorky Zhongwei Li Ph.D., docenta biomedicínské vedy na Lékarské fakulte FAU Charles E. Schmidta, kazdý organismus zije na stejném ze geny smerují produkci bílkovin.

Transferová RNA (tRNA) je molekula adaptéru, která je tvorena RNA (obvykle o délce 73 az 93 nukleotidu), která je pouzívána vsemi zivými organismy k prekonání ctyrmístného genetického kódu (ACGU) v messenger RNA (mRNA) s dvacet písmenného kódu aminokyselin v bílkovinách. Tým zduraznuje, ze tento proces se opírá o tRNA jako o nezbytnou slozku proteinového prekladu a puvodne se vyrábí jako prekurzor, který má extra cást na 5 'a 3' konci a nekdy i uprostred. Tyto extra cásti musí být odstraneny zpracováním RNA predtím, nez tRNA muze fungovat behem tvorby proteinu.
Zpracování konce tRNA 3 'je znacne komplikovanejsí a v nedávné dobe bylo v nekterých organizmech odhaleno. Organismy, které obsahují bunecné jádro jako clovek, se zdají zpracovávat koncem tRNA 3 'podobným zpusobem. Aby tRNA nesla stavební bloky bílkovin, musí být zpracována zcela.
Alluri poznamenal: "Zdá se, ze bakterie zpracovávají 3 'konec tRNA velmi odlisne. A stále se snazíme odhalit ruzné enzymy nazvané RNasy, které odstranují 3' extra cásti prekurzoru tRNA."
Vysvetluje, ze zatímco nekteré z RNáz delí RNA uprostred, jiné RNA odríznou od 3 'konce. Vetsina bakteriálních cest potrebuje nekolik RNáz pro dokoncení zpracování tRNA 3 '.
Li vysvetlil: "Vedet, jak je tRNA zpracovávána u ruzných druhu bakterií, je dulezitá nejen pro pochopení toho, jak bakterie zijí, ale také pro vývoj nových antibiotik, které specificky kontrolují bakteriální patogeny."
Soucasná práce s Alluri a Li je zalozena na bakterie Mycoplasma genitalium, coz je druhý nejmensí patogen, který je znám jako volne zijící organismus, který se domnívá, ze zpusobuje neplodnost. Genom Mycoplasma genitalium obsahuje pouze asi 10% genu, které byly objeveny u jiných bezných bakterií, ale neobsahuje zádnou známou RNázu pro zpracování tRNA 3 ', a proto potrebuje k tomu pouzít jinou RNázu.

Alluri uvádí:

"Co jsme objevili s Mycoplasma genitalium je, ze pouzívá úplne jinou RNázu nazvanou RNase R pro zpracování 3 'konce tRNA. RNase R muze trimovat 3' extra cást tRNA prekurzoru, aby vytvorila funkcní tRNA. je dokonce dostatecne inteligentní, aby rozpoznala nekteré strukturální rysy v tRNA a rekne, kde musí oríznutí zastavit, aniz by poskodilo zralou tRNA. "

Novým mechanismem zpracování 3 'tRNA je schopnost RNázy R úplne odstranit 3' extra RNA báze v jediné orezové reakci. Jiné mykoplasmy mají obvykle malé genomy a mají tendenci prípadne zpracovávat tRNA stejným zpusobem. Skutecnost, ze k provedení tohoto slozitého úkolu je nutný pouze jeden enzym, setrí genetické zdroje pro mykoplazmy.
Li prohlásil: "Dulezité je, ze blokování funkce RNázy R v mykoplazmech muze zastavit produkci bílkovin a zabíjet bakterie, címz je RNase R vynikajícím cílem nových antibiotik pro lécbu infekce mykoplazmou."
Napsal Grace Rattue