Obrovský zdroj informací o rakovine je verejný

Cílem personalizované medicíny je priblízit se, vedci, kterí navrhli protirakovinovou lécbu a klinické studie, mají nyní prístup k obrovskému zdroji znalostí o rakovine díky spolupráci mezi prumyslem a akademickou sférou. Zpráva v online vydání z 28 Príroda popisuje, jak Encyklopedie rakoviny bunecné linie (CCLE) sdruzuje genomové údaje a prediktory lékové odpovedi u 947 nádorových bunecných linií.
Konecná lécba rakoviny je taková, která odpovídá správné lécbe správnému cíli u správného pacienta. To je cíl osobního lékarství. Aby si vsak tento cíl uvedomil, je treba, aby návrhári lécby poznali specifické zmeny genomu v jednotlivci, jak citlivé jsou na konkrétní drogy a poté léky upravují.
Pro kazdou rakovinnou bunecnou linii CCLE sestavuje informace o genové expresi, poctu chromozomálních kopií a masivne paralelních sekvencních datech. Obsahuje také farmakologické profily pro 24 protirakovinových léciv pres zhruba polovinu bunecných linií.
CCLE je práce výzkumníku z Broad Institute, Institutu pro lécbu rakoviny Dana-Farber, Harvardské lékarské skoly a Novartis Institute for Biomedical Research.
Doufám, ze CCLE poskytne bohatý zdroj informací, který pomuze vedcum navrhnout klinické testy na testování techto léku.
Encyklopedie není v zádném prípade ukoncena: vedci tvrdí, ze výzva nyní znamená zvýsit pocet testovaných sloucenin v ruzných bunecných liniích.
Výzkumníci vybrali 947 z témer 1200 komercne dostupných rakovinných bunecných linií, které odrázejí genomovou rozmanitost lidských rakovin.
Nicolas Stransky, výpocetní biolog v programu proti rakovine u Broad a spoluzakladatele Príroda papír, rekl tisk:
"Jednou ze silných stránek CCLE je pocet bunecných linií, které zkoumá."
"Muzeme se zamerit na vzácné podtypy rakoviny a stále máme dostatecnou statistickou sílu pro analýzy," dodal.
Bunecné linie rakoviny jsou laboratore pestované zásoby ruzných typu rakovinných bunek, puvodne vzorkovaných z reálných nádoru. Za kontrolovaných laboratorních podmínek mohou rust neomezene a zajistují nepretrzité zásobování experimenty a pokusy, aniz by museli uchovávat odber vzorku od lidí.
Zatímco tato "nesmrtelnost" je výhodou pri opakování experimentu, muze to být nevýhoda, jestlize se v dusledku toho, ze se v laboratori pestují, se bunky prílis lisí od nádorových bunek, které se u lidí rozvíjejí.
Ale zdánlive, s nekolika málo výjimkami, bunecné linie CCLE jsou dobre sladeny geneticky s primárními nádorovými podskupinami pro ruzné typy rakoviny.
V tom, co se ukázalo být znacnou výpocetní výzvou, výzkumníci prizpusobili algoritmy biologických dat, aby korelovali více nez 50 000 genetických molekulárních rysu bunecných linií.
Overili hodnotu tohoto prístupu porovnáním výsledku s genetickými zmenami, o kterých je známo, ze predpovídají citlivost na léky proti rakovine.
A pouzívali tento nástroj k predpovídání citlivosti na léky v genetických podtypech rakoviny, o nichz je známo, ze predstavují výzvy pro urcitou lécbu.
Napríklad nekteré nádory mají mutace v genu NRAS, coz vyvolává signály dulezité pro rust nádoru. Nekteré druhy rakoviny s mutacemi NRAS, jako jsou nekteré melanomy, se mohou ukázat jako zranitelné léky, které blokují MEK, bílkovinu, která se rovnez podílí na signalizaci.
Pouzitím "bible" CCLE, vysetrovatelé byli schopni studovat asi 40 rakovinných bunecných linií s touto mutací, aby zjistili, zda mohou predpovedet citlivost na léky, které inhibují MEK protein. Nekteré léky jsou zkoumány v klinických studiích.
Z jejich analýzy videli, ze bunecné linie, které byly vysoce citlivé na MEK inhibitory, exprimovaly gen arylu uhlovodíkového receptoru (AHR). To naznacuje, ze vysoké hladiny AHR mohou být známkou vyssí citlivosti na inhibitory MEK.
Pri dalsím vysetrení zjistili, ze nekteré z techto bunecných linií mohou také záviset na AHR a v nekterých prípadech mohou inhibitory MEK také zachycovat nekteré funkce AHR.
To ukazuje, jak CCLE muze pomoci výzkumným pracovníkum rozhodnout, které nádory mají nejpravdepodobnejsí odpoved na konkrétní léky pred pokusem, uvedli vývojári.
To by umoznilo úcastníkum vybrat si na základe toho, jak budou pravdepodobne reagovat, vzhledem k genetickým a molekulárním vlastnostem jejich rakoviny.
CCLE umoznuje otázky nejen o objevujících se cílených terapiích, ale také o existenci chemoterapeutických léku.
Mohli by existovat zpusoby, jak identifikovat pacienty, u nichz je pravdepodobné, ze budou mít prospech z konvencní chemoterapie, na rozdíl od tech, kterí to mozná neudelají, s tím, ze by mozná lépe meli alternativu.
V dalsím príkladu vedci popisují, jak pomocí CCLE nalezli také nové prediktory citlivosti na existující chemoterapeutické léky v jiných bunecných liniích. Napríklad vyssí hladiny exprese SLFN11 predpovídaly citlivost vuci inhibitorum topoizomerázy.
A dalsí analýza naznacuje, ze mnohocetný myelom muze reagovat na inhibitory receptoru IGF1.
Formální klinické testy by musely být provedeny, aby se potvrdilo, zda tyto vlastnosti budou pravdivé u pacientu, uvedli výzkumní pracovníci.
Dalsí dávka informací, která má být pridána do CCLE, bude zahrnovat hlubsí sekvenování, profily metabolické aktivity a epigenetické modifikace.
Výzkum na výrobu CCLE byl hrazen grantem od Institutu Novartis pro biomedicínský výzkum s pomocí Národního institutu pro lécbu rakoviny, Starr Cancer Consortium a NIH reditele New Innovator Award.
Kliknete zde pro prístup k CCLE online.
Ve stejném císle Príroda existuje papír o samostatném podobném katalogu znalostí rakovinných bunek, který sestavují vedci z Massachusetts General Hospital a Institutu Sanger.Kliknutím sem zobrazíte nás prehled.
Napsal Catharine Paddock PhD

Proc se dobrý smích se svými práteli je pro vás dobrý

Fyzická námaha mít dobrý bricho se smát ve spolecnosti prátel, na rozdíl od zdvorilého titter, nás vycerpá tolik, ze vyrábíme ochranné endorfiny, které zvysují nás prah bolesti a delají nám dobrý pocit, podle nové mezinárodní studie vedené Oxfordskou univerzitou ve Spojeném království, která byla zverejnena online ve sborníku Královské spolecnosti B ve stredu.

(Health)

Krevní tlak je vyssí v noci nez puvodní myslenka

Krevní tlak merený v blízkosti srdce je v prubehu spánku výrazne vyssí, nez se puvodne predpokládalo, podle nové technologie vyvinuté vedci UCL. Krevní tlak v noci je dulezitým prediktorem mrtvice a srdecního onemocnení. Drívejsí výzkum naznacuje, ze krevní tlak vypocítaný pres rameno klesá v noci behem spánku.

(Health)