Deadly New Virus odhalil v Africe

Kousek genetické detektivní práce mezinárodního týmu odhalil smrtelný virus, který nebyl zaznamenán dríve, coz pravdepodobne zpusobilo malý izolovaný výskyt akutní hemoragické horecky v centrální Africe v léte roku 2009.
Vypuknutí epidemie v Konzské demokratické republice (DRC) zabilo dva lidi a zanechalo jednu vázne nemocnou osobu. Vedci dali smrtelnému patogenu název Bas-Congo virus (BASV), po provincii, kde zili tri lidé.
O své práci informují v casopisu otevreného prístupu online otevreného dne 27. zárí PLoS patogeny.
Vedci byli v mezinárodním konsorciu zahrnujícím University of California, San Francisco (UCSF), americkou spolecnost Microbiota a dalsí instituce a organizace v Americe a Africe.

Vypuknutí roku 2009

Výskyt akutní hemoragické horecky v roce 2009 zacal, kdyz se 15letý chlapec z vesnice Mangala v DCR náhle zhorsil a zacal krvácet z nosu a dásní a zvracení krve. On se zhorsil velmi rychle a zemrel o tri dny pozdeji.
O týden pozdeji zacala trináctiletá dívka, která sla do stejné skoly jako chlapec, se stejnými príznaky, které se také rychle zhorsily, a také za tri dny zemrela.
Pak znovu, dalsí týden poté, co dívka zemrela, muzská zdravotní sestra, která se o ni starala, zacala se stejnými príznaky. Byl preveden do nemocnice a prezil.
Vedoucím týmu UCSF byl Charles Chiu, odborný asistent laboratorní medicíny UCSF a reditel Abbottova virologického diagnostického a objevovacího centra. Ríká v tiskové zpráve:
"Jedná se o jediné tri známé prípady, i kdyz v budoucnu by mohlo dojít k dalsímu výskytu tohoto viru."

Deep Sequencing odhaluje BASV

Pocátecní testy známých viru na krevních vzorcích odebraných od prezivsích nezjistily nic. Ale nakonec, kdyz se dalsí clenové konsorcia zapojili, dalsí genetické testy odhalily zcela nový virus.
Tyto testy pouzívají nový prístup nazvaný "hluboké sekvenování", který generuje miliony sekvencí DNA z klinického vzorku a pak je spojuje pomocí pocítacových algoritmu a lidské analýzy.

Chiu ríká, ze nový virus, BASV, je docela odlisný od jiných viru v Africe, o nichz je známo, ze jsou za smrtícími ohnisky akutní hemoragické horecky, jako je virus Ebola, virus Lassa a virus Crimean-Kongo Hemorrhagic Fever.

BASV je víc jako beloch

Geneticky, BASV se více podobá virum vztekliny, které zpusobují jiný typ infekce, coz je neurologické onemocnení, které muze trvat mesíce, nez se vyvíjí, ale vzdy zabíjí, vysvetluje Chiu.
Virus patrí jako vzteklina k rodine nazvané rhabdoviry.
"BASV byl prítomen v krvi osamelého preziváka v koncentraci více nez milionu kopií na mililitr. Genom BASV, sestavený z více nez 140 milionu sekvencí, ukazuje, ze je velmi odlisný od vsech ostatních rhabdovirusu," písí autori .
Zádný jiný rhabdovirus není znám tím, ze zpusobuje akutní, rychlou a smrtelnou hemoragickou horecku, zaznamenanou ve trech prípadech v Kongu. Napríklad vzteklina muze být smrtelná, pokud není lécena, ale nedosahuje rychlého a smrtícího módu, který je videt u BASV.
Existuje vsak nejaký precedens: u ryb, kde je známo, ze rhabdoviry zpusobují hemoragickou septikémii (akutní krvácení a smrt).

Neznámá nádrz: Dalsí práce

Kdyz vedci provedli test protilátek na cloveka, který prezil, a ti, kterí s ním prisli do styku, dospeli k záveru, ze virus se muze sírit z cloveka na cloveka, pravdepodobný zdroj není u lidí, ale u jiného druhu, jako je hmyzu nebo hlodavce. Pravdepodobná "nádrz" a zpusob sírení viru je stále hledána.
Chiuuv tým stále pracuje na nových zpusobech diagnostiky nového viru, takze zdravotní úredníci ve strední Africe dokázou rychle identifikovat, pokud by doslo k dalsí epidemii.
Joseph Fair, spoluautor a viceprezident spolecnosti Metabiota, ríká:
"Známé viry, jako je Ebola, HIV a chripka, predstavují jen spicku mikrobiálního ledovce."
"Identifikace smrtelných neznámých viru, jako je virus Bas-Konga, nám dává kontrolu nad budoucími ohnisky," dodává.
Napsal Catharine Paddock PhD