Algoritmus Google vyhledává biomarkery pro lécbu rakoviny

Sedm proteinu, které mohou pomoci lékarum vyhodnotit, jak agresivní pacientka je rakovina a zda mají nebo nemají dostávat chemoterapii byly zjisteny nemeckými výzkumníky.
Pouzitím strategie podobného algoritmu Google PageRank, výzkumníci z technologické univerzity v Drázdanech v Nemecku dokázali zhruba 20 000 proteinu podle jejich genetické relevance pro vývoj rakoviny pankreatu. Studie je zverejnena v roce 2006 Výpocetní biologie PLoS.
Tým pouzil vlastní verzi algoritmu Google, aby identifikoval nové biomarkery, coz jsou molekuly produkované rakovinnými bunkami. Ackoli biomarkery mohou pomoci lékarum lépe odhalit rakovinu, jsou casto obtízné najít a casove nárocné. Navíc biomarkery, které se nacházejí v ruzných studiích pro stejné typy rakoviny, se témer nikdy neprekrývají.
Týmu se vsak tento problém vyhnul pomocí strategie Google. Výzkumníci vyuzili skutecnost, ze proteiny v bunce jsou propojeny prostrednictvím síte fyzických a regulacních interakcí; "proteinové Facebook" tak mluvit.
Christof Winter vysvetlil:

"Jakmile jsme pridali informace o síti v nasí analýze, nase biomarkery se staly více reprodukovatelnými."

Pomocí algoritmu Google a informací o této síti se výzkumníci shodli na predchozí studii z University of North Carolina. V tomto prekrytí byli vedci schopni identifikovat protein, který dokáze vyhodnotit agresivitu u rakoviny pankreatu.
Predtím, nez se tyto nové biomarkery mohou pouzít v klinické praxi, je treba je overit v rozsáhlejsích následných studiích. Jedním problémem vsak zustává - jak tyto poznatky zmenit na nové léky, které zpomalují progresi rakoviny. Klinická studie na lécivém prípravku proti rakovine slinivky brisní je v soucasnosti vedena týmem spolu s biotechnologickou spolecností RESprotect v Drázdanech.
Napsal Grace Rattue