Cholera sírení pochází z Bengálského zálivu

Pro vysledování zdroje a vysvetlení sírení nejnovejsí (sedmé) pandemie cholery bylo vysetrovatelum pouzito sekvenování prístí generace. Rovnez zduraznily dopad získání rezistence vuci antibiotikum na formování ohnisek a ukázaly, ze rezistence byla nejprve získána kolem roku 1982.
Zvlástní typ cholery, který je zodpovedný za soucasnou pandemii, muze být vysledován predchudci, který se pred 40 lety objevil v Bengálském zálivu, odhalilo celé sekvence genomu. Cholera se z tohoto predka opet rozsírila do ruzných oblastí sveta ve více vlnách.
Tyto objevy poskytují lepsí pochopení mechanismu sírení cholery, pruduskové infekce, která je obvykle spojena s nehygienickými podmínkami a spatnými hygienickými systémy a casto se vyskytuje v oblastech katastrof, jako je haitské zemetresení v ríjnu 2010. Odhaduje se, ze cholera ovlivnuje 3-5 milionu osob kazdý rok se 100 000 az 120 000 úmrtími.
Analýzou genomu bakterie Vibrio cholerae vyvolané u 154 pacientu po celém svete behem posledních ctyricet let sledoval tým sírení tohoto organismu. Se schopností sledovat jednotlivé zmeny DNA v genomu tohoto kmene byli vedci schopni mapovat prenosové cesty bakterií, pomáhat budoucímu plánování zdravotního stavu a umoznit návrat nemocí do puvodního stavu.
Soucasný kmen bakterií (kmen El Tor) se stal v roce 1982 nejprve rezistentní vuci antibiotikum tím, ze získal genetickou oblast SXT, která v té dobe vstoupila do bakterií, které generovaly obnovený celosvetový prenos z puvodního zdroje.
Dr. Julian Parkhill, prední vedoucí skupiny na Wellcome Trust Sanger Institute a hlavní autor studie vysvetlil:

"Porovnáním genomu 154 prípadu cholery jsme ucinili dulezité objevy, jak vznikla pandemie.
Nás výzkum ukazuje význam globálních prenosových událostí pri sírení cholery. To je v rozporu s predchozími presvedceními, ze cholera vzdy vznikají z místních kmenu a poskytuje uzitecné informace o porozumení vypuknutí cholery. "

Puvody pandemického kmene byly zásadne identifikovány vysetrováním a jeho koreny pred ctyrmi desetiletími v Bengálském zálivu. Od té doby infikovala jednotlivce po celém svete, vcetne Afriky, Jizní Asie a Jizní Ameriky. Nicholas Thomson z Institutu Sanger a jedním z prvních autoru vysetrování rekl:

"pri pohledu na posledních 40 let prenosu z kontinentu na kontinent jsme zjistili, ze Bengálský záliv pusobí jako nádrz pro choleru, kde se muze darit a sírit.
Sledováním zpusobu sírení nemoci mohou nase mapy prenosu ovlivnit budoucí rozhodnutí o tom, jak tuto chorobu resit. "

Ankur Mutreja, první autor institutu Sanger, vysvetluje, ze tyto objevy otevírají nové moznosti výzkumníku, kterí zkoumají vsechny oblasti bakteriální infekce: od zkoumání toho, jak genetické zmeny umoznují kmenum vytváret rezistenci vuci antibiotikum, vysledovat to zpet na koreny. Tyto primární nálezy mohou být klícem k odemknutí nekolika dalsích bakteriálních pandemií.
Profesor G Balakrish Nair, reditel Národního ústavu cholery a enterických onemocnení v Kolkatu v Indii, ríká:

"Jedná se o první vysetrování, které spojuje evolucní data se vznikem soucasných nových variant Vibrio cholerae a poté pouzívá fylogenetické podpisy ke sledování mezikontinentálního sírení cholery.
Tyto objevy nám vcas povedou, abychom pochopili, proc pandemie cholery zacínají v jihovýchodní Asii a pak se sírí jako vlna po celém svete. "

Napsal Grace Rattue