Tiny DNA ctenár se hlásí rychle, levné Sequencing

Vyhlídka na dostupnou personalizovanou medicínu s pouzitím "genomového sekvenování behem cekání" byla priblízena tento týden, kdyz studie vedená profesorem fyziky z University of Washington ukázala, jak muze malý nanoscale senzor císt sekvenci jedné DNA molekuly zpusobem to slibuje, ze bude levná a rychlá.
Taková technika by umoznila sírení DNA sekvence, která by umoznila individuálnímu lécení pomoci jednotlivcum zjistit, zda jsou náchylní k rakovine, cukrovce, závislostem a dalsím onemocnením s genetickými rizikovými faktory.
Jens Gundlach, který se popisuje jako experimentální fyzik se zájmem o základní fyziky a biofyziky, a kolegové, píse o své práci v on-line vydání Prírodní biotechnologie.
Popisují, jak pripojením molekulárního motoru k nanoporéznímu otvoru pro proteiny se jim podarilo dostat DNA vlákno, které se pohybuje po jednom póru jedním nukleotidem, coz jim umoznuje císt malé charakteristické iontové proudy kazdého nukleotidu zpusobem, který pripomíná starých stroju s tagerovou páskou pouzívaných pro ctení informací prenásených telegrafními linkami.
Gundlach rekl médiím, ze jejich práce ukazuje "jasnou cestu k funkcní, snadno vyrobené sekvencní platforme".
Ve svém príspevku popisují tým, ze pomocí nové nanoporové techniky správne identifikují sest jiz známých sekvencí DNA o délce 42 az 53 nukleotidu.
Geneticky modifikovali bílkovinové nanopory z bakterie nazývané Mycobacterium smegmatis porin A (MspA), který má otvor o velikosti priblizne 1 miliardy metru, jen dost velký, aby umoznil projít jediným vláknem DNA.
Oni uzavreli póry MspA v lipidové dvojvrstvé membráne a celý se vykoupali chloridem draselným. Aplikace napetí na membránu vytvárí iontový proud, který protéká bílkovinovým pórem, takze kdyz molekuly procházejí otvorem, vytvárí malou, ale zjistitelnou zmenu proudu.
Myslenka technologie nanopore, která prinásí rychlejsí, levnejsí sekvenování DNA (omezuje pocet potrebných kroku, napríklad pri ctení genomu cloveka), není nová. Na nem pracuje mnoho soukromých a akademických výzkumných center.
Ale to, co delá tento systém odlisný, dovoluje tomu, aby byl DNA retezec v jednom okamziku tazen jedním nucloetidem, který byl dostatecne pomalý k identifikaci kazdého ze ctyr DNA nukleotidu, cytosinu, guaninu, adeninu nebo thyminu, .
Predchozí systémy nebyly schopny rozlisovat mezi ctyrmi ruznými nukleotidy.
Gundlach rekl:
"Motor pritahuje vlákno pórou rychlostí desítek milisekund na nukleotid, coz je dostatecne pomalé, aby bylo mozné císt aktuální signál."
Tým delal motor z virového replikacního enzymu nazývaného bacteriophage DNA polymerase (DNAP) phi29.
Vedci z univerzity v Kalifornii, Santa Cruz, zkouseli motor, který pouzíval tento enzym, ale pouzili jiný pór, který nedokázal rozlisit nukleotidy.
Tým naznacuje, ze tato technika muze být pouzita k detekci epigenetických zmen v DNA. Epigenetické zmeny jsou dulezité pro veci, jako je rakovina: ukazují, jak mohou být pokyny obsazené v DNA exprimovány v bunkách jinak.
Schopnost zaznamenat epigenetické zmeny "je jedním z kouzel metodou nanoporového sekvenování," rekl Gundlach.
Program financovaný Národním výzkumným ústavem lidského genomu (NHGRI) pomohl financovat výzkum. Cílem programu je najít zpusob, jak poslouzit individuální DNA za méne nez 1000 dolaru.
Grundlach rekl, ze pole se "pohybuje rychle". Kdyz zacal program NHGRI, náklady na jednotlivé sekvence DNA by byly v sesti císlech. Nyní, "s takovými technikami by se mohla dostat k projektu genomu na 10 dolaru nebo 15 minut," rekl.
Napsal Catharine Paddock PhD

Etapy demence: Jak se nemoc mení v prubehu casu?

Obsahy typu demencí Jak se v prubehu casu mení príznaky demence? Jak se moznosti lécby mení v prubehu casu? Diagnóza a výsledek Bydlení s demencí v pozdejsích stadiích Demence není specifická nemoc nebo nemoci. Zahrnuje radu príznaku spojených se zhorseným myslením, pametí a komunikací.

(Health)

Odborníci se zabývají minulostí, soucasností a budoucností diabetu

Behem posledních 50 let se lécba a výsledky spojené s diabetem dramaticky zmenily. Na nedávném sympoziu se experti podívali zpet na to, jak se behem posledních peti desetiletí zmenily zivoty, a co je treba resit behem prístích peti let. Zpusob, jakým lze sledovat hladiny glukózy v krvi, se za posledních 50 let dramaticky zmenilo, s mnoha neinvazivními metodami.

(Health)