Celý cerný genom smrti sekvenován

Celý genom Cernosské smrti, která je jednou z nejzávaznejsích epidemií v dejinách lidstva, byla zarazena podle vedcu z Kanady, Nemecka a USA podle clánku publikovaného dnes Príroda. Ríkají tomu predchudce vsech moderních epidemií a dodávají, ze je poprvé, co nekdo dokázal navrhnout rekonstruovaný genom jakéhokoliv raného patogenu.
Autori ríkají, ze nyní budou schopni sledovat, jak se vyvinul patogen a zda a jak se jeho virulence casem zmenila. Jejich studie polozila základy pro hlubsí pochopení infekcních onemocnení.
V nedávno publikované studii vysvetluje stejný tým, jak se podarilo vyradit miniaturizované fragmenty DNA agenta, který zpusobil Black Death, a prokázal, ze urcitá varianta Yersinia pestis bakterie zpusobily epidemii, která utlumila 50 milionu obyvatel Evropy mezi lety 1347 a 1351.

Yersinia pestis, varianta této bakterie, zpusobila Black Smrt, která zabil 50 milionu Evropanu
Genetik Hendrik Poinar z univerzity McMaster v Kanade vysvetlil, ze jejich dalsím krokem je pokusit se "zachytit" a sekvenci celého genomu.
Poinar rekl:

"Genomické údaje ukazují, ze tento bakteriální kmen nebo variant je predchudcem vsech moderních epidemií, které dnes máme po celém svete." Kazdé vypuknutí na celém svete dnes pochází z potomka stredovekého moru. patogen, vstupujeme do nové éry výzkumu infekcních onemocnení. "

Johannes Krause z univerzity v Tubingenu v Nemecku uvedl:

"S vyuzitím stejné metodologie by nyní melo být mozné studovat genomy vsech typu historických patogenu," rekl Krause, jeden z vedoucích autoru studie. "To nám poskytne prímý pohled na vývoj lidských patogenu a historických pandemií."

Dnesní patogeny, které kazdorocne zabíjí priblizne 2 000 lidí, jsou prímí potomci té samé bublinové moru.
Dýmejový mor je zoonotické onemocnení - muze být prenáseno ze zvírat na cloveka - které cirkuluje hlavne mezi malými hlodavci a blechami, které je napadají. Jedná se o jeden ze trí typu infekcí zpusobených Yersinia pestis. Bubonská mor zabije asi ctyri dny z kazdé tri infikované osoby, pokud nedostane lécbu.

Poinar rekl:

"Zjistili jsme, ze v 660 letech evoluce jako lidského patogenu doslo k pomerne málo zmenám v genomu starodávného organismu, ale tyto zmeny, at uz jsou malé, mohou nebo nemusí znamenat známou zvýsenou virulenci chyby, která zpustosila Dalsím krokem je urcit, proc to bylo tak smrtící. "

Biogenetická technologie dnes vede k tomu, ze vyhlídky na obnovu DNA a sekvenování starých vzorku jsou mnohem praktictejsí, vysvetlují autori. Tím, ze jsme pochopili, jak se vyvinuli starovecí patogeny, jsme lépe schopni porozumet vlastnostem a vlastnostem vznikajících a znovu objevujících se infekcí.
Sharon DeWitte z univerzity v Jizní Karolíne, Kirsten Bos z univerzity McMaster, a Verena Schuenemannová z univerzity v Tubingenu analyzovali, co zbylo z kostlivcu obetí v "Smithových polích" v East Smithfield v Londýne. Od té doby, co byla tam pohrbena, byla královská mincovna postavena na vrcholu. Vybrali slibné exempláre, o kterých vedeli, ze stále mají stopy Y. pestis po dukladném vysetrení, z dentální pulpy peti obetí.
Vedci se podarilo extrahovat, ocistit a obohatit vzorky, aby mohli identifikovat morovou DNA, na rozdíl od DNA z houbových, lidských a jiných ne-morových DNA.
Dokázali vypocítat vek Yersinia pestis ' predchudce, který zpusobil Cernou smrt spojením dat 1349-1350 skeletových zbytku s genomickými daty.
Data se sdruzovala kolem 12. az 13. století, coz znamená, ze starsí rany byly pravdepodobne zpusobeny jiným patogenem predku. Odborníci predtím verili, ze napr. Justinianská epidemie 6. století byla zpusobena stejným patogenem jako stredoveká Cerná smrt. Je pravdepodobné, ze Justinianova mor zpusobila celosvetovou smrt zhruba 100 milionu lidí - rozsírila se pres východní rímskou Rísi na východ a dál se rozsírila.

Napsal Christian Nordqvist